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Genome-TALER? TALEN 和 TALE定制服务


TALEs首先是在植物病原菌黄单胞菌(Xanthomonas)中发现的。当感染植物时,病原菌分泌的TALEs识别宿主植物靶基因的启动子区,调控相应基因的表达。TALE蛋白中间含有一个重复区域,该区域由33-35个氨基酸的重复单元组成。每个重复单元的氨基酸序列高度保守,除了第12位和13位的两个氨基酸可变,即重复单元可变的双氨基酸残基(RVD)。TALE单体通过RVD识别DNA靶点上的碱基,有如下一一对应关系:NI = A, HD = C, NG = T,NN = G 或 A。

转录激活因子样效应子(TAL effectors)已广泛应用于靶向基因组操作蛋白的制备:通过融合表达核酸酶、转录因子或其他功能的结构域构建位点特异的内切酶(TALEN)、靶基因转录调控因子(TALE-TFs)或者其他基因组修饰蛋白。TALE融合蛋白通过TALE特异性识别结合染色体上靶序列进行靶向基因组编辑,比如基因敲除、基因敲入(结合使用重组供体质粒)、基因组修饰、基因转录激活或抑制等。不同于识别3联体碱基的锌指蛋白,TALE单体通过一一对应的关系精确识别单个碱基(A, T, C, G),因此可以针对基因组上任意目标序列设计组建TALE模块。


Illustration-of-TALEN-design

图 1. TALEN设计示意图


Illustration-of-TALE-TF-design

图 2. TALE-TF设计示意图



TALEN 及 CRISPR-Cas9 体系应用对比


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